Dejavnosti UNHCR so številne in se med seboj dopolnjujejo. Med drugim so to: operacije nujne pomoči, pravna zaščita, spremljanje in ovrednotenje nacionalnih politik, zagovorništvo, zbiranje sredstev, izgradnja kapacitet in informiranje javnosti. 

Agencija OZN za begunce uporablja pri delu v srednji Evropi štiri glavna orodja, prek katerih uresničuje svoj mandat ter zagotavlja beguncem, prosilcem za azil in osebam brez državljanstva podporo in zaščito. Osnovne aktivnosti UNHCR v regiji so: zaščita, zagovorništvo in razvoj politik, krepitev usposobljenosti, zmogljivosti in partnerskih odnosov ter informiranje javnosti. Več o omenjenih aktivnostih si lahko prebereš spodaj.