97 procent budżetu UNHCR pochodzi z dobrowolnych datków rządów, instytucji międzyrządowych, osób indywidualnych, fundacji i przedsiębiorstw. UNHCR otrzymuje zaledwie trzy procent swoich środków finansowych z budżetu ONZ.

W ciągu roku UNHCR stara się pozyskać środki na potrzeby swoich programów, aby sprostać nagłym sytuacjom kryzysowym. Otrzymywane przez UNHCR hojne i zależne od aktualnych potrzeb dotacje umożliwiają skierowanie środków tam, gdzie są one najbardziej potrzebne. UNHCR przyjmuje także dotacje rzeczowe takie jak namioty, lekarstwa, ciężarówki i w formie usług, jak np. transport powietrzny.

W 2010 roku UNHCR wprowadził swój pierwszy oparty na globalnych potrzebach budżet, który odzwierciedla kompleksowe ewaluacje we wszystkich krajach, w których UNHCR działa. Całkowite potrzeby  na rok 2011 wynoszą 3,32 mld USD i jest to największy, jak do tej pory, budżet agendy. Potrzeby regionu Europy Środkowej wynoszą około 13,3 mln USD.

Co roku darczyńcy, w tym rządy krajów Europy Środkowej, deklarują swoje dotacje na kolejny rok podczas corocznej konferencji UNHCR (pledging conference). W grudniu 2010 roku darczyńcy obiecali w skali globalnej 576,5 mln USD z przeznaczeniem na początkowe finansowanie UNHCR w 2011.

UNHCR spodziewa się dodatkowych środków w ciągu roku, aby móc zapewnić jednakową ochronę i pomoc wszystkim potrzebującym, tak w regionie Europy Środkowej, jak i na całym świecie.