Kancelář generálního inspektora (IGO) sídlí v ústředí UNHCR v Ženevě a plní tři svěřené funkce: 

• hodnotí kvalitu řízení UNHCR a hledá preventivní opatření proti špatnému hospodaření a mrhání zdroji; 
• vyšetřuje podezření z porušování předpisů u osob pracujících pro UNHCR, včetně dočasných zaměstnanců; 
• vyšetřuje násilné útoky proti personálu UNHCR a obecně proti působení UNHCR, ale i další typy událostí, které by mohly mít dopad na pověst organizace. 

Pokud vyšetřování odhalí nedostatky v administrativních nebo operačních zásadách, předpisech, směrnicích, postupech nebo praxi, IGO odešle zprávu Vysokému komisaři, případně příslušnému vysokému manažerovi spolu s doporučenými kroky a opatřeními. IGO provádí pravidelné inspekce operací a kanceláří UNHCR na celém světě s cílem zajistit, že jsou provozovány v souladu se všemi předpisy a nařízeními. 

Vyšetřovací oddělení kanceláře generálního inspektora přijímá oznámení a vyšetřuje podezření na případy porušování předpisů a zákonů ze strany pracovníků UNHCR. Jeho úkolem je shromažďovat fakta, nikoliv uplatňovat kárný nebo represivní postup. Pokud vyšetřování přinese důkazy naznačující, že podezření z porušování předpisů a zákonů je opodstatněné, IGO předloží vedoucímu úseku lidských zdrojů a řízení UNHCR předběžnou zprávu, aby rozhodl, jak postupovat dále. 

Výstupy vyšetřovací jednotky IGO mohou vést k disciplinárnímu nebo administrativnímu opatření, včetně takových sankcí, jako je propuštění při závažném porušení předpisů, snížení hodnosti nebo funkce, odložení povýšení či písemná důtka.