Основната цел на ВКБООН е да гарантира правата и благосъстоянието на бежанците. Службата се стреми да осигури на всички възможността да упражняват правото да търсят убежище и да намерят закрила в друга държава или да се върнат по родните си места по безопасен и запазващ достойнството им начин.

Понякога бежанците не могат нито да се завърнат по родните си места, нито да останат в страната на първо убежище. За тази уязвима категория мъже, жени и деца Агенцията на ООН за бежанците ВКБООН работи за намиране на алтернативно решение за съдбата им: презаселване в трета страна, където могат да започнат отначало.

ВКБООН има мандат също да предотвратява и намалява случаите с липса на гражданство и да предоставя закрила на апатридите. В подкрепа на основните дейности за подпомагане на бежанците Изпълнителният комитет на ВКБООН и Общото събрание на ООН упълномощиха агенцията да подпомага и бежанците, които са се завърнали по родните си места, както и вътрешно разселените лица.

Във всички свои дейности ВКБООН обръща особено внимание на потребностите на уязвимите групи и насърчава равни права за жените и момичетата.